2020年1月10日，具有研究生毕业同等学力人员申请医学硕士专业学位工作座谈会在京召开。与会代表就同等学力工作中的组织管理、部门协调、申请条件、申请规模、异地申请、经费投入、师资建设及课程体系建设等多方面展开了热烈研讨。

2020年1月4-5日，全国医药学学位与研究生教育创新与发展研讨会在太原胜利召开。来自全国106所高校800余名代表参会。此次会议60余位专家学者为大会带来了异彩纷呈的学术盛宴。

2月份开始，开展全国性的摸底工作，向教育部提交了《关于临床医学、口腔医学硕士专业学位研究生返岗参加住院医师规范化培训情况的调研报告》，收集139所医学院校的在校研究生数据，为政府决策提供依据。同时，组织专家编写临床医学、公共卫生、护理、口腔医学《专业学位学科发展报告》，推动学科发展。

新冠疫情发生以来，微信公众号“医者仁心 教者恒心”开设《抗击新冠肺炎》专栏，自2月1日起每天发布防疫指南与政策、宣传先进事迹等文章270篇。“中国医药学研究生教育信息网”开辟了《抗击疫情 共克时艰——新型冠状病毒感染肺炎疫情医学院校防控工作专题》，发布相关疫情文章共137篇。中国医药学研究生在线教育平台开设了“医药学研究生教育公益在线讲座”栏目，内容涉及新型冠状病毒防护知识、突发事件心理危机干预以及流行病学、传染病学等，共计17个讲座。

2020年4月，教指委向教育部提交《公共卫生研究生教育面临的挑战与问题》报告，建议设立专项项目，推动高层次应用型公共卫生人才培养。

2020年5-11月，启动基于“中国医药学研究生在线教育平台”的医药学研究生教育在线课程建设与教学研究课题立项组织工作，经过专家函评，线上报告会评，80个课程建设类和教学研究类项目获批立项。

2020年5月11日，主办公共卫生专业学位水平评估指标讨论会。与会专家围绕公共卫生学科专业人才培养中的职业素养教育、课程教学质量、实践教学效果、双聘教师带教、毕业论文选题、就业岗位分布等实际问题，结合公共卫生特点，展开深入交流。

2020年6月-11月，组织2018年研究课题结题工作，有193项课题项目完成结题申请。

2020年7月发布高校、学会、平台三方框架课程合作协议，有12所院校有意向参与三方合作。秋季学习，平台新增课程60余门，截至2020年12月平台课程总数近200门。

为深入学习贯彻习近平总书记关于研究生教育工作的重要指示精神和全国研究生教育会议精神，学会秘书处7月整理编订了《适应党和国家事业发展需要培养造就大批德才兼备的高层次人才——全国研究生教育会议材料汇编》。

2020年7月，教育部办公厅 国家卫生健康委办公厅下发《关于实施高层次应用型公共卫生人才培养创新项目的通知》。随后，教指委受教育部、国家卫健委委托制定《项目评审办法》，组织实施函评和会评工作。

2020年7月7日，教指委组织医学专业学位授权点专项评估工作培训会，向参评单位介绍评估政策、程序以及院校评估准备经验。

2020年8月25日下午，全国全科医学研究生教学师资和管理人员培训会成功在线召开。本次会议由全国医学专业学位研究生教育指导委员会主办，北京大学研究生院医学部分院承办。会议旨在进一步促进全科医学事业发展，加强全科医学学科建设与人才培养，提升全科医学师资和管理人员水平。6655人在线参加会议。

2020年9月25日，召开教指委全体委员会暨专家评审会。教指委组织有关专家对参评的专业学位授权点提交材料进行网络通讯评议。对参评单位进行表决。随后向国务院学位委员会提交《2020年医学专业学位授权点专项评估的报告》。

2020年9月，为深入贯彻党的十九大关于实现高等教育内涵式发展的要求，落实全国研究生教育会议精神，加强研究生课程建设，提高研究生培养质量，医学教指委受国务院学位办委托组织全国专家编写了组织编写医学类别《专业学位研究生核心课程指南（试行）》并出版发行。

2020年9月，在教育部的指导下，全国医学专业学位研究生教育指导委员会下发了《关于调整优化临床医学专业学位领域设置的通知》，将临床医学专业学位的领域设置由原来的19个优化调整至26个。此次领域调整涉及临床医学专业学位硕士、博士两个层次，增列了骨科学、儿外科学、放射肿瘤学、医学遗传学、重症医学等领域。

2020年11月，教育部办公厅、国家卫健委办公厅联合下发《关于批准高层次应用型公共卫生人才培养创新项目立项单位的通知》批准北京大学等11所单位为高层次应用型公共卫生人才培养创新项目立项单位。

为进一步推动医学“双一流”建设联盟工作，协同推进医学高校“双一流”建设，医学“双一流”建设联盟工作会议于2020年12月10日在北京召开。会议进一步加强了医学“双一流”建设联盟的凝聚力，明确了下一阶段的工作任务。会上就《联盟章程》作了修订，进一步明确了理事、专家咨询委员会、工作组专家调整机制，表决增列山东大学和西安交通大学为理事单位。

2020年12月10-11日，第三届全国医学“双一流”建设论坛在北京隆重召开。本次论坛由医学“双一流”建设联盟主办，北京大学医学部承办。大会得到广大医学院校的积极参与，来自全国55所医学院校的200余名代表参加论坛。46所高校及医院设置了分会场集体在线观看直播，累计点播量5.3万人。

为贯彻党的教育方针，扎实推进研究生教育改革发展，学会秘书处12月整理编订了《立德树人 服务需求 提高质量 追求卓越——全国研究生教育会议材料及政策文件汇编》。